Đường cao tốc Ninh Bình – Hải Phòng – Quảng Ninh điểm đầu tại Nút giao Minh Khai (Giao với cao tốc Hạ Long - Vân Đồn và QL18A) chạy qua địa bàn các phường, xã, thị trấn: Đại Yên (thành phố Hạ Long), Hoàng Tân, Tân An, Tiền An, Hà An, Phong Hải, Liên Hòa, Phong Cốc, Yên Hải, Liên Vị (thị xã Quảng Yên) của tỉnh Quảng Ninh; Đông Hải 1, Đông Hải 2, Nam Hải, Tràng Cát (quận Hải An), Hải Thành, Hòa Nghĩa (quận Dương Kinh), Tân Phong, Tú Sơn, Đoàn Xá (huyện Kiến Thụy), Hùng Thắng, Đông Hưng, Tây Hưng (huyện Tiên Lãng) của thành phố Hải Phòng; An Tân, Hồng Dũng, Thụy Trình, Diêm Điền, Thái Nguyên, Hòa An, Thái Xuyên, Mỹ Lộc (huyện Thái Thụy), Đông Trà, Đông Xuyên, Đông Trung, Đông Phong, Đông Cơ, Đông Lâm, Tây Tiến, Nam Chính, Nam Hồng (huyện Tiền Hải) của tỉnh Thái Bình; Giao Thiện, Giao An, Giao Hà, Giao Hải, Giao Châu, Giao Yến, Giao Tân, Giao Thịnh (huyện Giao Thủy), Hải Phúc, Hải Nam, Hải Hưng, Hải Bắc, Hải Trung, Hải Anh, Hải Minh (huyện Hải Hậu), Trực Đại, Trực Cường, Ninh Cường, Trực Hùng (huyện Trực Ninh), Nghĩa Sơn (huyện Nghĩa Hưng) của tỉnh Nam Định; Khánh Thành, Khánh Thủy, Khánh Hội, Khánh Hải, Khánh Vân, Khánh Cư, Khánh An, Khánh Hòa (huyện Yên Khánh) của tỉnh Ninh Bình; điểm cuối giao với đường cao tốc Hà Nội – Ninh Bình thuộc xã Khánh Hòa, huyện Yên Khánh, tỉnh Ninh Bình.